加拿大CryoSPARC机器算法平台在冠状病毒疫苗研究中发挥关键作用

加拿大的Structura Biotechnology公司开发了用于生物学研究和药物发现的机器学习算法和科学软件，该公司开发的工具在寻找冠状病毒疫苗的“关键突破”中起着关键作用。

得克萨斯大学奥斯汀分校（UT Austin）和美国国立卫生研究院（NIH）的研究人员都依赖Structura Biotechnology的cryoSPARC平台，该平台用于分析冷冻EM数据和3D重建，并提供专有算法膜蛋白，离子通道，G蛋白偶联受体和药物靶标。

从多伦多大学的一个研究项目中分离出来的Structura Biotechnology正在利用算法和软件来帮助扩展密码电子显微镜（cryo-EM）的结构生物学技术。Cryo-EM使科学家可以通过在冷冻样品上发射电子来获得高分辨率的蛋白质图片。Structura Biotechnology的cryoSPARC工具通过将计算机视觉和机器学习相结合来发挥作用，以帮助科学家将二维图像组合成3D模型，从而揭示其形状和结构，从而更好地了解蛋白质在分子水平上的作用。

UT奥斯汀分校分子生物科学副教授，冠状病毒研究者Jason McLellan说，cryoSPARC帮助他的团队在旅行时处理数据。研究人员能够在12天之内从原始样品制作出蛋白质的原子级图谱，然后将手稿提交给科学期刊。

研究人员声称，他们已经创建了冠状病毒刺突蛋白的第一个3D原子比例图，这是冠状病毒附着并感染人类细胞的一部分。研究人员正在使用cryoSPARC处理冠状病毒刺突蛋白的数据，并实时获取刺突的准确3D图像。

世界卫生组织已宣布新型冠状病毒或COVID-19成为全球公共卫生紧急事件。迄今为止，已确认的病例超过76,000，死亡人数超过2,200。截至2020年2月25日，加拿大确诊 11例COVID-19 ，其中安大略3例，不列颠哥伦比亚6例。更多的加拿大人受到加拿大境外病毒的影响，“钻石公主”号游轮上爆发了COVID-19 ，至少有47名加拿大人被感染。

Structura Biotechnology的首席执行官兼联合创始人阿里·旁贾尼（Ali Punjani）说：“ UT奥斯汀大学和美国国立卫生研究院的研究证明了结构生物学的力量。” “实际上，我们可以查看几个月前发现的一种新疾病，并观察其在分子水平上的作用。”

Structura Biotechnology正在为学术研究人员和制药公司开发一种恢复3D蛋白结构的方法，其目的是消除药物发现中的一些猜测。

Punjani说，全球有400家机构使用了该公司的技术，其中包括加利福尼亚大学伯克利分校，病童医院和其他结构生物学实验室。Structura Biotechnology目前拥有7名全职员工，并计划在软件工程，机器学习研发和销售方面雇用更多员工。